O pastor Silas Malafaia foi incluído no inquérito da Polícia Federal que já investigava o ex-presidente Jair Bolsonaro, o deputado federal Eduardo Bolsonaro (PL-SP) e o jornalista Paulo Figueiredo. A apuração, sob relatoria do ministro Alexandre de Moraes no Supremo Tribunal Federal (STF), apura crimes de coação no curso do processo, obstrução de investigação de organização criminosa e tentativa de abolição violenta do Estado Democrático de Direito.

Segundo a PF, o objetivo da investigação é identificar ações para atrapalhar o andamento de processos judiciais e interferir nas apurações da tentativa de golpe de Estado. Há indícios de que o grupo teria atuado, inclusive, para influenciar autoridades no exterior contra decisões do Judiciário brasileiro.

O inquérito foi aberto em maio de 2025 e já vinha reunindo elementos contra Bolsonaro e seus aliados mais próximos. A inclusão de Malafaia reforça a linha de apuração sobre a participação de figuras políticas e religiosas na mobilização e sustentação de atos antidemocráticos.

A defesa de Silas Malafaia ainda não se manifestou sobre a inclusão do pastor no inquérito.